EU:n Itämeren alueen strategia on kehys, jonka piirissä koordinoidaan kaikkia toimia strategian toimeenpanon hyväksi ja tarjotaan strategista apua ja ohjausta Itämeren alueen toimijoille. Yksi strategian perusperiaatteista on, että sitä varten ei perusteta uusia rakenteita tai rahoitusinstrumentteja. Itämeri-strategian toimeenpanon rahoituksen tulee siis löytyä jo jostakin olemassa olevasta rahoitusohjelmasta tai -intrumentista.
On olemassa monia rahoitusohjelmia ja -mekanismeja, jotka sopivat EU:n Itämeri-strategian toteutukseen. Monikansallisiin yhteistyöhankkeisiin on uudella rahoitusohjelmakaudella 2014–2020 mahdollista hakea rahoitusta useimmista EU-ohjelmista. Yleisimmin Itämeri-strategiaa toteuttavia hankkeita rahoitetaan EU:n rakennerahastojen Euroopan alueellinen yhteistyö (EAY) -tavoitetta toteuttavista kahdesta ohjelmasta, Interreg Itämeren alueen ohjelmasta ja Interreg Central Baltic -ohjelmasta.
Valikkoon on listattu joitain EU:n rahoituslähteitä, joilla voidaan rahoittaa EU:n Itämeren alueen strategiaa toteuttavia hankkeita Suomessa.